內政部強調，將依國際及國內疫情發展狀況，持續與宗教團體溝通大型活動的因應方式，對人數眾多、極為擁擠群聚的室內及大型活動，請宗教團體務必要有立即做好延期舉辦的備案。
內政部也表示，為避免群聚風險，目前已有許多宗教活動，決定延期或停辦，或是改以線上直播等方式讓信眾參與。此外，大甲媽祖遶境活動，也已表示將因應疫情延期。內政部感謝宗教團體積極配合協助防疫工作，減少人群聚集接觸感染風險。
長老教會和台灣信義會提因應
台灣基督長老教會針對四月21至24日即將舉辦的第65屆總會通常議會，將持續注意疫情發展，亦會配合內政部政策，研議相關備案，採取因應措施辦理，將於三月24日後宣佈。
台灣信義會吳英賓監督則表示，總會原本要辦的一些大型聚會也有延後或提備案的打算。各堂會該做的防疫措施，包括聚會前的消毒、全面量額溫、強制戴口罩、手部酒精消毒等措施；從疫情地區來的會友，都暫停聚會。主日仍然維持，但也開放直播，讓不方便來的會友參加主日。
真理堂提醒疫區返台會友暫停聚會
鑑於疫情提高，台北真理堂即日起啟動防疫措施，呼籲會友切實遵守防疫事項，以維護全體會友及家人平安健康。教會也提醒從疫情地區第一級（泰國）、第二級（日本、新加坡、義大利、伊朗）、第三級（中港澳、韓國）返台未滿14天之會友或工作人員（全職同工、保全、清潔、廠商…），應暫停聚會或上班，14天內請勿進入教會場所。經醫療單位確認健康無虞，再恢復聚會或上班。
對於有呼吸道症狀或發燒（額溫超過37.5℃）或疑似感冒者，教會要求勿進入會場所，直到就醫確認無虞再恢復聚會。也請他們在家利用教會官網「第一或第二堂直播或錄影」參加主日崇拜，也可以線上視訊方式參與小組及禱告聚會。
靈糧堂各分堂是依照各地的實際需要來自行訂定。台北靈糧堂在入口處設置酒精消毒液，進入大樓或會堂者前，務必先使用酒精消毒，並自備口罩配戴。近期由中國（含港澳等地)入境之會友或同工，建議在家自主隔離14天。宣教大樓、靈糧山莊及福音中心也皆在明顯處設置告示牌宣導相關衛教資訊。而聚會地點之電梯按鈕、樓梯扶手、親子室、飲水機按壓點……等公共區域，清潔人員將定期消毒。
基隆靈糧堂主任牧師周學仁表示，以基隆靈糧堂為例，因為位處商業大樓，除了與台北靈糧堂母堂同樣的防疫衛教與防護作為外，並增訂「倘若基隆市有確診病例，教會就會配合相關因應措施關閉部分公共區域，並於入口處確實執行體溫量測及消毒」，若是弟兄姊妹在參加聚會過程中，出現發燒、咳嗽以及呼吸急促等情況，教會就會登錄資料後鼓勵暫停聚會就醫，做好相關防護。
旌旗教會
旌旗教會詳列聚會和暫停辦法
台中旌旗教會公布「新型冠狀病毒Covid-19防疫措施辦法」，詳細列出各式聚會防疫辦法、宣導方式、母堂暫停聚會因應方案。內容包括服事背心不重複使用；聚會期間維持通風：開啟空氣交換機、保持大門開啟，使空氣流通；聚會交換場時間，請同工將環境座位作消毒液噴灑（次氯酸水）；聚會後公共區域地面則使用稀釋漂白水擦拭，清潔人員於聚會期間，每小時使用酒精加強消毒，包含電梯按鍵、門扇、把手、廁所（馬桶蓋／水龍頭／門把／沖水握把……）等。分散座位：將座位間距拉大至少80cm，引導會眾隔位入座。
此外，「教會會友」若有1人確診，教會暫停開放性聚會，改為線上主日、線上小組、線上領袖之夜、線上培育課程，其於學習圈課程、講座活動、專案活動延後開課或暫停舉辦（依專案團隊公告執行）。「母堂全職同工」若有1人確診，教會停止上班上課14日，暫停任何開放性聚會，但維持線上小組模式。
高市府提出500人以上聚會停辦基準
因應新冠肺炎疫情，高雄市政府日前公告「室內場域活動停辦基準」，規定公家機關500人以上的聚會活動，無論任何條件一律停辦，民間團體則建議比照辦理。
針對聚會的安全性，高雄浸宣武昌教會除了提醒弟兄姊妹出入人多的公眾場合，記得要勤洗手，注意自己的體溫狀況，並記得配戴口罩外。
該教會第三堂主日崇拜（10:30-12:00），即日起將開放「網路直播」，減少群聚機會，並提供在家自主管理的會有能一同參與聚會，也鼓勵弟兄姊妹多一分禱告、少一分憂慮，共同經歷真平安的時刻。
